1、医院污水的消毒方式很多，如液氯法、臭氧法、次氯酸钠法、二氧化氯法等。但常用的消毒方法是：氯化法它具有投配方便、价格低廉、可靠性高等优点，臭氧法用于医院污水消毒，可有效地杀灭大肠菌，小儿麻痹等病毒。
2、首先，一般来说，医院废水处理需要经过生化处理。这种处理方式可以利用微生物的作用来降解废水中的污染物质，以达到净化水的目的。生化处理可以使用的设备包括生物滤池、厌氧反应器、好氧反应器等。而具体的生化处理方式需要根据被处理废水的特性来定制。
3、二氧化氯法。二氧化氯是一种强氧化剂，它可以杀灭细菌，繁殖体，真菌和病毒等。有关研究表明，二氧化氯溶于水后，有50%-7o%转变为次氯酸根离子和亚氯酸根离子，对红细胞有损害，会干扰人体对碘的吸收，还可以使血液胆固醇升高。因此，目前一般用前两种方法处理医院污水。
4、虽然医院废水的大体情况是差不多的，但是处理工艺还是要根据处理目标而定：（一）传统工艺——活性污泥法（实例）1 格栅井 功 能：放置格栅。污水中含有大量较大的悬浮物和漂浮物，格栅的作用是截留并去除上述物质，对水泵和后续处理单元起保护作用。
5、医院废水消毒处理常见的两种方法：氯化法和臭氧法。1 、氯化法处理医院废水：氯作为一种氯化和消毒的化学药剂，从十九世纪英国皇家污水委员会首次应用污水处理至今，已有一百多年的历史。氯化法处理根据投加氯化物的不同又分为次氯酸钠法、液氯法和二氧化氯法。
6、医疗废水处理目前使用较多的是化学法，医疗废水要经过多道程序处理后才能排放。处理流程大致如下：针对污水中微生物、致病菌等，可选择二氧化氯消毒剂进行水体的消毒清洁。
达到国家规定的排放标准后，方可排入污水处理系统。8．禁止丢弃医疗废物，禁止在非贮存地点倾倒，堆放医疗废物或将医疗废物混入其他废物和生活垃圾。9．加强监督，定期检查。10．医疗废物收集人员应做好个人防疫工作，以防感染疾病。为切实落实本制度，特设专人管理。
医疗废物中病原体的培养基、标本和菌种、毒种保存液等高危险废物，在交医疗废物集中处置单位处置前应当就地消毒。第二十条 医疗卫生机构产生的污水、传染病病人或者疑似传染病病人的排泄物，应当按照国家规定严格消毒；达到国家规定的排放标准后，方可排入污水处理系统。
对外运的医疗废物必须做好交接工作，并认真记录，内容包括医疗废物的种类、数量、交接时间、集中处置单位以及经办人签名。登记资料至少保存两年。医院内产生的污水应按国家的有关规定进行严格的消毒后再排入污水处理系统。
第二十条 医疗卫生机构产生的污水、传染病病人或者疑似传染病病人的排泄物，应当按照国家规定严格消毒；达到国家规定的排放标准后，方可排入污水处理系统。 第二十一条 不具备集中处置医疗废物条件的农村，医疗卫生机构应当按照县级人民政府卫生行政主管部门、环境保护行政主管部门的要求，自行就地处置其产生的医疗废物。
第十九条 医疗卫生机构应当根据就近集中处置的原则，及时将医疗废物交由医疗废物集中处置单位处置。第二十条 医疗卫生机构产生的污水、传染病病人或者疑似传染病病人的排泄物，应当按照国家规定严格消毒；达到国家规定的排放标准后，方可排入污水处理系统。
医院里的废水含有多种致病菌，直接排放会引起地下水或河流的污染，因此要进行合理的处理净化后，符合国家规定的污水排放标准，才可以排放。医院污水处理可以使用二氧化氯消毒粉（医院污水处理专用），含量有10%和48%两种。配合污水处理设备，将粉剂的AB剂分别溶化后，倒入要处理的污水中。
小型医院污水由于规模小，水量小，可以选择小剂量的污水处理设备，药剂可以选择二氧化氯消毒粉（医院污水处理专用）或者过硫酸氢钾复合盐（活性氧处理剂）。
经此处理的医院污水，可大大提高排放标准，甚至可返回作为非饮用水使用。
现代污水处理技术，按处理程度划分，可分为一级、二级和三级处理，一般根据水质状况和处理后的水的去向来确定污水处理程度。一级处理 主要去除污水中呈悬浮状态的固体污染物质，物理处理法大部分只能完成一级处理的要求。经过一级处理的污水，BOD一般可去除30%左右，达不到排放标准。